Реку Миасс используют для промышленных нужд ещё с XVIII века. Со временем вдоль её течения построили плотины и водохранилища, и на берегах выросли города. В воду попадали промышленные и коммунальные стоки.
Одной из давних проблем остаётся Карабаш: через Сак‑Элгу тяжёлые металлы попадают в Миасс и Аргазинское водохранилище. Источниками служили отходы старых производств.
В Челябинске реку загрязняют нефтепродукты: они попадают в ливневую канализацию из‑за дорог, утечек топлива и незаконных подключений. В августе 2025 года у Ленинградского моста зафиксировано пятно площадью более 12 тысяч м².
Сейчас со дна Миасса убирают ил и другие отложения. К сентябрю 2026 года извлекли более 3 млн м³; всего планируют убрать около 7,5 млн м³. Но чтобы результат сохранялся, необходимо параллельно устранять источники загрязнения.
